Trieda Zend_Mail nekontroluje správne nastavenie znakovej sady v jednotlivých častiach e-mailu. Pri vytváraní inštancie Zend_Mail je možné nastaviť inú znakovú sadu ako iso-8859-1, ktorá je ako východzia. Každá časť, ktorá je pridaná k vytvorenému objektu musí mať správne nastavenú znakovú sadu. Pre každú časť MIME e-mailu je možné nastaviť inú znakovú sadu.