Zend_Mail nie sprawdza poprawności zestawu znaków poszczególnych części wiadomości. Kiedy tworzymy instancję Zend_Mail, możemy wybrać zestaw znaków dla wiadomości. Domyślny to iso-8859-1. Aplikacja musi zadbać o to, aby wszystkie części dodane do obiektu wiadomości miały zawartośc zakodowaną w prawidłowym zestawie znaków. Kiedy tworzymy nową część wiadomości, możemy użyć innego zestawu znaków dla każdej z części.